Більша частина професійної кар'єри 45-річного Ботнараша пройшла в Молдавії. У 80-90-ті роки минулого сторіччя він захищав кольори тираспольського "Автомобіліста", кишинівського "Ністру"/"Зімбру" і бельцької "Зарі".
До переходу в "Металург" Сергій Ботнараш тренував голкіперів у кишинівської "Дачії", повідомляє "Одеський футбол".